根據流行區(qū)具體情況，因時因地制宜進行防治。采取以滅螺與普治患者、病畜為重點，結合糞便與水源管理及個人防護的綜合性措施。
1.控制傳染源 在流行區(qū)進行普查，對患者與病牛進行大規(guī)模同步治療。應用吡喹酮擴大化療以控制血吸蟲病流行，可使患者數大幅度下降，這是整個防治工作中重要的一環(huán)，尤其在湖沼地區(qū)與山區(qū)經過連續(xù)3年后將有顯著成效。耕牛血吸蟲病可采用硝硫氰胺混懸液1.5～2mg/kg體重，一次靜脈注射有良好療效。
2.切斷傳播途徑 滅螺前首先應查清螺情，建立螺情圖，為提供滅螺規(guī)劃的依據。在水網地區(qū)可采取改變釘螺滋生環(huán)境的物理滅螺如土埋法等。在湖沼地區(qū)可采用筑壩、圍墾、種植的方法。在居民點周圍建立防螺帶等?；瘜W滅螺可結合物理滅螺進行，采用氯硝柳胺等殺螺藥物，并可制成緩釋劑，延長其滅螺的效果，但目前大多數滅螺劑雖然對農作物與人畜無害，但對魚類有毒，應防止其水源污染。
糞便管理：防止人糞與畜糞污染水源，并經過處理使之無害化，如采取糞尿1∶5混合后密封、沉淀發(fā)酵，夏季貯存3～5天，冬季7～10天，可殺死血吸蟲卵。此外，在農村采用沼氣糞池，應大力推廣。
水源管理：保護水源不受污染。提倡用進水，或將河水貯存3天后使用。必要時用含氯石灰，每擔水(約50kg)加1g，消毒15min后即可使用。
3.加強個人防護，保護易感人群
(1)關鍵在于宣傳教育：引導人們重視自我保護，在流行區(qū)盡量避免與疫水接觸，例如嚴禁兒童在河溝中戲水。湖沼地區(qū)因收割捕撈，打湖草等必須接觸疫水時，應采取個人防護措施，以脂肪酸為基質，加堿皂化后，摻入氯硝柳胺(2%)和松節(jié)油制成防護劑，有殺死尾蚴作用。1%氯硝柳胺堿性溶液浸漬衣褲對尾蚴也有預防作用。
(2)預防性服藥：青蒿素衍生物蒿甲醚(artemether)和青蒿琥酯(artesunate)能殺滅5～21天的血吸蟲童蟲。蒿甲醚用法：在接觸疫水后15天服用1次蒿甲醚(每次6mg/kg)，以后15天1次，連服4～10次。青蒿琥酯用法：在接觸疫水后7天服用1次青蒿琥酯(每次6mg/kg)，以后1次/周，連服8～15次，可有效地預防血吸蟲感染。據1996～1998年曾在江西、安徽、湖北三省推廣應用青蒿琥酯，預防服藥近20萬人群，其保護率達88.2%～100%;蒿甲醚也曾在上述地區(qū)應用2000多人(1994～1996)，其保護率也達60%～100%。